Bom dia!

Olá Jana, tudo bem?

Depende do tipo de afastamento. Se o afastamento for justificado por atestado médico e não houver desconto no salário, ele não altera o rendimento bruto do empregado, e a pensão será calculada normalmente sobre esse valor.
Por outro lado, se o afastamento não for justificado e gerar desconto no salário, isso reduzirá o rendimento bruto do mês, o que pode impactar no valor da pensão alimentícia, considerando que a base de cálculo são os rendimentos brutos, descontados apenas o INSS e o Imposto de Renda.

Espero ter ajudado.