Olá Raul
Nesse caso, será preciso de duas alterações contratuais. A Primeira de alteração de Natureza Jurídica EI para LTDA Unipessoal, após deferido o processo vem a segunda alteração de Alteração de sócios. Infelizmente ainda não é possível transferir uma empresa EI para outro responsável.
Espero ter ajudado.