Olá Gabriel
Sim, é possível ter o MEI e ser Produtor Rural (Bloco de Produtor Rural). São atividades distintas e cada uma tem sua Receita, devendo sempre ter uma separação e controle.
Lembrando que o Produtor Rural PF precisa estar atento ao Livro Digital Rural e ao Imposto de Renda.
Espero ter ajudado.