@Pamela Lopes Boa noite, desculpe a demora, não estava aparecendo sua resposta para mim!
Você escolhe é lucro presumido ou real conforme a emissão da sua guia!
Para emitir a guia precisamos ir por parte!
Por exemplo para emissão da guia de ICMS vai ser diretamente da receita estadual do seu estado, precisa ser enviado a efd ICMS e depois gerado a guia.
ISS, precisa ser gerado através da prefeitura do seu municipio!
PIS e Cofins, você precisa enviar a EFD Contribuições e depois a DCTF onde você vai informar os valores a recolher de PIS/COFINS/IRPJ e CSLL para emitir a guia vai ser através do Sicalc!
Espero ter ajudado!