Olá Shirley, tudo bem?
Nessa situação, o mais indicado é entrar em contato diretamente com a Prefeitura do Rio de Janeiro e com a SEFAZ/RJ para verificar quais documentos podem ser aceitos e como regularizar a inscrição estadual.
Como a situação é bem específica, eles poderão orientar sobre alternativas, como o uso do TUAP ou outros comprovantes que permitam a formalização da IE para o MEI.
Espero ter ajudado!