Obrigações Trabalhistas MEI

Olá!

Gostaria de tirar uma dúvida. O MEI fez o registro de uma funcionária em agosto de 2021, ela trabalhou apenas o período de experiência de 90 dias.

Para regularizar, fiz a entrega da DCTFWEB, e o desligamento da funcionária na competência de novembro de 2021. Porém, observei que não foi gerado a guia do FGTS, gostaria de saber como consigo emitir a guia?

Em relação a rescisão, ao seguir com a inclusão do desligamento, foi gerado termo de rescisão. A cliente informou que pagou a funcionária na época, mas o valor pago não confere com a rescisão. Como proceder neste caso, ela deve pagar a diferença a ex-funcionária?

Como o desligamento foi feito de forma retroativa, existe algum problema recolher o FGTS e o INSS apenas agora? Poderá acarretar algum tipo de problema a ela?