Olá Luiara
Para constar os débitos de 2024, primeiro precisa enviar a declaração Anual do MEI. Aguarde 24h para sistema processar e entender que as guias estão em aberto.
Após isso, você pode cancelar o parcelamento ativo e solicitar o outro no mesmo dia. Pagando a primeira parcela, já pode solicitar o enquadramento como MEI.
Em relação ao pagamento da PGFN, as vezes sistema demora para reconhecer, mas se está pago, fique tranquilo que não terá problemas. Caso sistema não reconheça e te impeça de optar pelo MEI, basta abrir um processo e enviar a documentação comprobatória de que pagou a guia antes do Prazo final.
Espero ter ajudado.