Olá Maria Clara, tudo bem?
O MEI só consegue ficar com 1 parcelamento ativo por vez. Neste caso, você teria que cancelar o atual para fazer um novo mesmo.
Porém, quando se faz um primeiro reparcelamento a entrada desse novo parcelamento é de 10% do valor total da dívida. Se for o segundo reparcelamento, é de 20%. Então, você precisa comunicar o seu cliente sobre isso.
Espero ter ajudado!