Olá Charles, boa noite.
Para resolver a situação dos pagamentos feitos com o CPF em vez do CNPJ, é necessário realizar um procedimento de retificação. Aqui estão os passos que sua cliente pode seguir:
1. Retificação dos Pagamentos: Sua cliente deve solicitar a retificação dos pagamentos dos boletos para que sejam reconhecidos sob o CNPJ da empresa. Isso pode ser feito por meio de um processo de retificação junto à instituição financeira ou ao órgão competente.
2. Pró-labore sem Faturamento: Em relação ao pró-labore, mesmo que a empresa não tenha tido faturamento nos últimos meses, o sócio administrador pode ser remunerado com pró-labore, pois ele remunera o trabalho na gestão da empresa. No entanto, se não houve entrada de recursos, é importante avaliar a capacidade financeira da empresa para suportar essa despesa.
3. Consultoria Contábil: É recomendável que sua cliente consulte um contador ou uma assessoria contábil para obter orientação específica sobre como proceder com a retificação dos pagamentos e a questão do pró-labore, especialmente considerando as particularidades do aplicativo Agilize da Nubank e a situação financeira atual da empresa.
Lembre-se de que a correção desses pagamentos é importante para manter a conformidade fiscal e contábil da empresa.
Espero ter ajudado!