Olá Eduardo
A parte do INSS pago na Guia DAS MEI não entra na declaração de IR.
Nesse caso, o valor pago a título de previdência como autônomo, vai ser lançado na Aba de rendimentos recebidos de pessoa Física, onde tem um campo específico para previdência, pois esse valor não é sobre rendimentos recebidos do MEI, logo não se pode lançar junto.
Espero ter ajudado.