Olá Mariane, tudo bem?
Na prática, o MEI não é obrigado a ter pró-labore, pois o valor pago no DAS já cobre a contribuição previdenciária mínima como contribuinte individual.
Se ele quiser comprovar renda, o ideal é fazer isso por meio de uma declaração de rendimentos do MEI (como retirada de lucros), sem necessidade de lançar pró-labore nem enviar e-Social.
Agora, se o MEI insistir em ter um contracheque formal, aí sim pode ser feito o lançamento como pró-labore no e-Social, com a tributação normal:
INSS de 11% sobre o valor pago;
IRRF, se o valor ultrapassar o limite de isenção.
Espero ter ajudado.