Boa tarde, Mateus,
A SIEG é uma das opções mais consolidadas do mercado para captação e organização de XML, e a integração dela com o Domínio funciona bem na prática para a maioria dos escritórios. O ponto que você levantou sobre o Paraná é real: o estado não disponibiliza as NFC-e no ambiente da SEFAZ para consulta por terceiros da mesma forma que outros estados fazem, então a captação automática dessas notas fica mesmo dependente de o cliente compartilhar o XML diretamente pelo sistema emissor ou por e-mail. Isso não é uma limitação exclusiva da SIEG, qualquer sistema de captação vai esbarrar nessa mesma questão no Paraná, porque o problema está na política de disponibilização da SEFAZ estadual, não na ferramenta.
Para NF-e de entrada e saída, CT-e e NFS-e de municípios que já aderiram ao padrão nacional, a captura costuma funcionar bem. O gap mesmo fica concentrado nas NFC-e paranaenses, o que infelizmente é uma realidade que o escritório precisa contornar com uma rotina de solicitação de XML junto aos clientes ou pedindo que eles configurem o sistema emissor para encaminhar automaticamente.
Outras opções que os escritórios costumam usar com o Domínio são o MasterXML e o Arquivei. O Arquivei tem boa reputação para organização e consulta, mas a integração direta com o Domínio para importação automatizada pode exigir alguma configuração adicional. O MasterXML também tem integração com o Domínio e é uma alternativa que vale pesquisar. Antes de fechar com qualquer um, vale perguntar diretamente ao fornecedor como ele lida especificamente com NFC-e do Paraná, peça referências de escritórios que usam o sistema nesse estado, porque é justamente nesse ponto que a promessa comercial às vezes não bate com a realidade operacional.
Se a sua carteira tem muitos clientes varejistas no Paraná que emitem NFC-e em volume, esse gap vai ser sentido no dia a dia independentemente do sistema escolhido, e a solução mais realista é criar um processo de recebimento de XML com esses clientes fora da captação automática