Consignado não foi incluído na folha de pagamento

Olá! Um funcionário contratou empréstimo consignado CLT em abril, para começar a ser descontado em maio. Por um lapso, não inclui o empréstimo dele na folha. Só percebi agora na hora de fazer a de junho, mas resolvi esperar pra ver como resolver o problema de maio. Qual seria o procedimento depois que o erro foi cometido?