Olá Silvia, tudo bem?
O valor do benefício é, sim, calculado com base na média dos 12 últimos salários de contribuição anteriores ao mês do início do benefício (ou do parto, se o pedido for feito depois). Ou seja, o INSS pega os 12 últimos valores sobre os quais ela contribuiu e faz a média aritmética simples.
Se ela recebe um pró-labore fixo e contribui mensalmente com o INSS sobre esse valor, essa média será basicamente igual ao valor do pró-labore mensal. Se houver variação ou interrupções, isso pode impactar o valor do benefício.
O ideal é manter o pró-labore e as contribuições regulares e coerentes com o valor que se deseja usar como base futura para o benefício. Se houver intenção de aumentar esse valor, é necessário fazer isso com pelo menos 12 meses de antecedência do parto para impactar a média de forma positiva.
Espero ter ajudado.