Olá Juan, tudo bem?
Você irá precisar retificar ou criar uma nova vigência e reenviar os eventos no e-Social, especialmente os de tabela (S-1005 e S-1020), corrigindo a informação dos terceiros. Depois disso, reenvie os eventos periódicos da competência desejada (S-1200, S-1210, S-1299) e aguarde a reabertura da DCTFWeb com os valores ajustados. Com a retificação feita e aceita, já será possível transmitir o PER/DCOMP com base no crédito.
Vou deixar o link da aula para melhor entendimento: https://alunos.contabilidadefacilitada.com/137981-departamento-pessoal-na-pratica/3227580-s-1005-tabela-de-estabelecimentos
Espero ter ajudado.