Olá Ana Carolina, tudo bem?
Esse problema acontece porque, apesar da multa ter sido gerada e paga, o evento de desligamento (S-2299) provavelmente não foi enviado corretamente no e-Social ou foi enviado com erro. Sem esse evento, a Caixa não reconhece a rescisão e o FGTS não é liberado para saque. A orientação é revisar e, se necessário, reenviar o S-2299 com o motivo de desligamento correto. Após o envio, o sistema do FGTS Digital e da Caixa será atualizado, liberando o saque para o trabalhador.
Espero ter ajudado.