Olá Matheus, tudo bem?
Quando a DCTFWeb é retransmitida após o envio da EFD-Reinf, os pagamentos podem não aparecer automaticamente como vinculáveis porque o sistema só reconhece os valores vinculados à versão original da declaração. Para vincular corretamente: é necessário retificar a DCTFWeb e aplicar a vinculação. Se mesmo assim o pagamento não aparecer, será preciso fazer uma PERDCOMP (pedido de compensação) referente ao valor pago e, depois, voltar na DCTFWeb, retificar, aplicar a vinculação e transmitir novamente.
Espero ter ajudado.