Olá William
Desenquadrar e virar ME no mesmo CNPJ - É como crescer oficialmente. O CNPJ continua o mesmo, só muda o regime.
Vantagens:
Mantém o histórico da empresa (bom para crédito e fornecedores).
Não precisa fechar e abrir tudo de novo.
É o caminho mais seguro e comum.
Desvantagens:
Começa a pagar mais tributos.
Terá mais obrigações contábeis.
Fechar o MEI e abrir outro CNPJ como ME - é como recomeçar do zero, você encerra o MEI e cria uma nova empresa.
Vantagens:
Zera o limite de faturamento.
Permite repensar o tipo de empresa.
Mas...
Perde o histórico (crédito, contratos, notas).
Tem custo de abertura e riscos fiscais — pode ser visto como tentativa de burlar o sistema.
Melhor opção: normalmente é desenquadrar e continuar com o mesmo CNPJ. Fechar e abrir outro: só vale a pena se realmente for outro negócio, com nova estrutura ou atividade.
Espero ter ajudado.