Olá Débora, tudo bem?
Acredito que você esteja se referindo a situação que aparece na imagem abaixo:

Neste caso, acredito que não se trata de um pedido para apresentar uma retificação. Isso acontece porque, anteriormente, a obrigação era 'apresentar a declaração'. Agora que ela já foi entregue, qualquer modificação será considerada uma retificação, mas você só irá fazer se tiver necessidade.
Caso não seja isso, particularmente nunca vi a Receita Federal solicitar que um MEI retifique a declaração. Nessa situação, recomendo que você entre em contato diretamente com a Receita Federal para obter orientações mais precisas.
Espero ter ajudado!