Olá Mariana, tudo bem?
Não, o MEI não consegue cadastrar autônomo no e-Social para emitir RPA. O sistema do e-Social Simplificado para o MEI só é utilizado quando o MEI tem empregado com carteira assinada (CLT). A contratação de autônomos por MEI não é registrada no e-Social.
Espero ter ajudado.