Olá, Cinelma! Tudo bem?
Você pode avaliar com o seu cliente o que é mais interessante para ele.
Se ele precisa manter o mesmo CNPJ (devido a conta bancária, fornecedores, cadastros), basta fazer o desenquadramento do MEI.
Agora, se para ele não faz diferença manter esse número de CNPJ, é possível baixar o MEI e abrir uma LTDA.
Segue as aulas sobre desenquadramento:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/138359-curso-pratico-de-mei/3219064-desenquadramento
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/138359-curso-pratico-de-mei/3219067-comunicacao-do-desenquadramento
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/121631-lives-regimes-de-tributacao/5067751-mei-tudo-o-que-voce-precisa-saber-sobre-desenquadramento
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/121631-lives-regimes-de-tributacao/3654344-pratica-desenquadramento-mei-e-particularidades-entre-alguns-estados
Espero ter ajudado.