Olá Marcos, tudo bem?
Como a sua cliente atua de forma autônoma, ela não precisa emitir NFSe e sim apenas o receita saúde. Já que atende apenas pessoas físicas.
Quanto a emissão do recibo ela deve ser feita no ato do pagamento, como nos diz o manual disponibilizado pela Receita Federal. Abaixo a orientação via manual do Receita Saúde:
3 - Quando o Recibo deve ser emitido? Ele deve ser emitido na data do pagamento da prestação do serviço. Caso o pagamento seja parcelado, deverá ser emitido um recibo para cada parcela paga.
Espero ter ajudado.