Olá! Boa tarde Julie.
Vamos por partes.
Você precisa tirar uma situação cadastral no E-cac da empresa para verificar dividas federais e declarações omissas.
Para a baixa da empresa não é necessário registro no CRC, porem caso existam declarações omissas, muitas dependem de assinatura do contador, ai vai depender do que tem em aberto para envio.
Sobre a GFIP vai precisar fazer esses envios sim, porem para fazer voce vai precisar do certificado digital seu com CEI (que seria necessário o (CRC até onde sei) posso estar enganada) ou o certificado digital da empresa.
Dividas municipais vai precisar ir a prefeitura da cidade onde a empresa da sua mãe está localizada. (na minha cidade a prefeitura cobra alvará mesmo a empresa não estando ativa).
Estadual você vai precisar entrar em contato via site ou telefone com a receita estadual do seu estado.
Sobre a divida Federal é bom dar uma olhada no registrato com o CPF da sua mãe.
Espero ter ajudado.