Rafael, então desde que não seja um cnpj Mei, pode abrir sim. Porém te oriento analisar o cnpj em questão se é viavel resolver as pendencias. Agora se realmente for abrir um outro, não há impedimentos, porém é mais preferencial vc baixar o cnpj com débitos, entretanto os debitos incritos em dívidas irão para o CPF do Titular como có-responsável pela empresa.
Esses débitos em divida se não parcelar pode impedir ao crédito do Pronampe.
No entanto o programa do Pronampe é necessário está em dias com os pagamentos dos tributos mensais, pq é compartilhado direto do ECAC os faturamentos da empresa, diretamente com os Bancos, onde irá solicitar a análise de crédito da nova empresa.
Epsero ter ajudado