Olá Vandeir
A Junta Comercial de Goiás permite a assinatura através da conta do gov.br, mas o nível precisa ser Ouro.
Sim, o CNPJ precisa do certificado digital para enviar as obrigações acessórias.
Infelizmente não é possível transformar o MEI direto para LTDA com sócio. Precisa transformar primeiro em LTDA unipessoal e depois realizar um novo processo de alteração Contratual informando a entrada dos novos sócios.
Espero ter ajudado.