Olá Joyce
Para enviar o DBE, você pode utilizar seu Certificado Digital PF, desde que possua uma procuração para representar a empresa. Caso contrário, é recomendável enviar o documento com o Certificado Digital do CNPJ da empresa. Ao enviar o DBE, selecione o evento de alteração de contabilista. Dessa forma, será exibido um campo para inserir os dados do contador e estabelecer sua responsabilidade pelo CNPJ.
Espero ter ajudado.