Olá Tiago, tudo bem?
O caminho correto é desenquadrar o MEI e seguir com a transformação ma junta comercial, etc.
Encerrar o MEI e abrir uma nova empresa "do zero" pode parecer mais simples, mas pode gerar complicações fiscais. As vezes neste momento a receita federal e estadual não identificaram tal excesso de faturamento, mas eles podem notificar depois.
Espero ter ajudado!