Olá Tais, bom dia.
Depende das suas praticas contábeis, uma maneira seria:
Venda e Emissão da Nota Fiscal:
Débito: Clientes (Ativo Circulante) pelo valor total da venda.
Crédito: Receita de Vendas pelo valor total da venda.
Descontos de Frete e Taxas:
Débito: Despesas com Frete (Despesa Operacional) pelo valor do frete.
Débito: Despesas com Taxas (Despesa Operacional) pelo valor das taxas do Mercado Livre.
Crédito: Clientes (Ativo Circulante) pelo valor total dos descontos.
Recebimento do Valor Líquido:
Débito: Caixa ou Bancos (Ativo Circulante) pelo valor líquido recebido.
Crédito: Clientes (Ativo Circulante) pelo valor líquido recebido.
Espero ter ajudado