Olá Erick, boa noite.
A emissão de uma nota fiscal antes do empenho é, de fato, uma irregularidade na execução orçamentária. No entanto, existem algumas maneiras de corrigir essa situação:
Cancelamento da NF-e: Se possível, a nota fiscal eletrônica (NF-e) emitida incorretamente pode ser cancelada.
Emissão de Carta de Correção Eletrônica (CC-e): Caso haja erros na nota fiscal, uma Carta de Correção Eletrônica (CC-e) pode ser emitida para corrigir determinados equívocos.
Geração de Nota Fiscal de Substituição: Em alguns casos, pode ser necessário emitir uma nota fiscal de substituição.
Emissão de Nota Fiscal Complementar: Se a nota fiscal original não refletir o valor total da operação, uma nota fiscal complementar pode ser emitida.
Além disso, é importante registrar um passivo (fornecedores a pagar) com indicador de superávit financeiro “P” (Permanente) em contrapartida a uma VPD.
Por fim, é essencial verificar possíveis impedimentos legais, como as condições de habilitação.
Espero ter ajudado!