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Olá Luana, tudo bem?
Geralmente os sistemas, já leem arquivos em Excel, txt e Ofx pra poder agilizar a contabilização do movimento financeiro.

Porém, cada sistema funciona de uma forma. Você vai precisar entrar em contato com o seu sistema para verificar como fazer esse procedimento de parametrização de integração dentro do seu sistema e orientar seu cliente a enviar o movimento financeiro dele pra você, nesses formatos que seu sistema aceitar a integração (geralmente o mais utilizado é a planilha de Excel).

Espero ter ajudado!