Olá Ayme
MEI não pode ter CNPJ de Filial, é uma empresa única, caso queira abrir uma Filial seria preciso alterar a empresa para ME e abrir o CNPJ de Filial.
Para saber se é possível a transferência de mercadorias entre empresas do mesmo dono, precisa saber o motivo do impedimento da venda desse perfume no Estado, pois também pode ser vedada a transferência dessa mercadoria entre empresas do mesmo dono.
Recomendo que veja o motivo da não comercialização do perfume no Estado e se existe vedação a sua entrada no Estado
Espero ter ajudado.