Olá Anna, tudo bem?
Em relação à primeira pergunta, acredito que não tenha necessidade de abrir uma filial, e também não parece haver impedimentos para essa operação entre os estados.
Quanto à tributação dos produtos, será necessário buscar orientação junto a uma consultoria tributária para esclarecer qualquer dúvida quanto a tributação dos produtos em questão, pois será necessário fazer a consulta de cada NCM.
Espero ter ajudado!