Olá Ricardo
“Informar o total das despesas da pessoa jurídica no período abrangido pela declaração. Consideram-se despesas pagas as decorrentes de desembolsos financeiros relativos ao curso das atividades da empresa e inclui custos, salários e demaisdespesas operacionais e não operacionais.” MANUAL DEFIS
Ou seja, você deve incluir o valor do Simples Nacional.
Espero ter ajudado.