Olá Victor, tudo bem?
Você pode começar a pagar os 28% de pró-labore a partir de agora.
Mas o enquadramento no Fator R depende da média dos últimos 12 meses.
Como os meses anteriores ficaram com valor baixo, o cliente só vai entrar no Anexo III quando essa média atingir os 28%.
Nós temos uma aula sobre fator R neste link:
https://alunos.contabilidadefacilitada.com/236228-rotina-pratica-para-empresas-do-simples-nacional/4684018-fator-r
Acredito que pode te auxiliar também.
Espero ter ajudado!