Olá Eduarda
No SPED Fiscal (EFD ICMS/IPI), o perfil A, B ou C indica apenas o nível de detalhamento das informações exigidas, e não tem relação direta com o regime tributário da empresa, ou seja, empresas do Lucro Presumido podem estar em qualquer um desses perfis.
O perfil é definido pela SEFAZ estadual, com base no porte, volume de operações e risco fiscal da empresa, e não é escolhido pelo contador. O Perfil A exige o maior detalhamento, o Perfil B é intermediário e o mais comum para empresas do Lucro Presumido, e o Perfil C é o mais simplificado, hoje pouco utilizado.
Na prática, o perfil correto costuma vir automaticamente no sistema ou é validado pelo próprio PVA do SPED Fiscal, que acusa erro se estiver incorreto.
Espero ter ajudado.