Boa tarde, Eslaine,
Essa situação é bastante comum no sistema do IBAMA e costuma gerar bastante confusão justamente porque o portal demora para refletir os pagamentos realizados.
O que provavelmente está acontecendo é que a baixa automática depende da comunicação entre o banco arrecadador, a Receita Federal e o sistema do IBAMA, e esse fluxo pode levar alguns dias úteis a mais do que o esperado, especialmente em parcelamentos administrativos de multas ambientais. Vinte dias sem baixa, porém, já é um prazo que justifica acionar o órgão formalmente.
O canal mais indicado para resolver isso é o Fala.BR, que é a plataforma oficial de atendimento ao cidadão do Governo Federal, acessível em falabr.cgu.gov.br. Por lá, você registra uma manifestação diretamente endereçada ao IBAMA, anexa o comprovante de pagamento de cada parcela quitada e solicita expressamente a regularização do status no sistema. Esse registro gera um protocolo com prazo de resposta obrigatório, o que torna o acompanhamento muito mais eficaz do que tentativas de contato informal.
Outra via é o atendimento direto pelo portal do IBAMA, em ibama.gov.br, na seção de serviços ou fale conosco, onde é possível abrir chamado com o número do processo de parcelamento. Se o parcelamento foi firmado junto a uma superintendência regional do IBAMA, também vale contato direto com aquela unidade, pois em alguns casos a regularização depende de intervenção manual por parte de um servidor da área de arrecadação.
O ponto mais importante é sempre ter em mãos o comprovante bancário original do pagamento, o número do DAE ou guia paga, e o número do processo administrativo do parcelamento. Com essa documentação, o pedido de baixa manual fica bem fundamentado e tende a ser resolvido com mais agilidade