Olá, Débora, tudo bem?
Normalmente, os sistemas de parcelamento geram automaticamente as condições do parcelamento, incluindo valor da entrada e número de parcelas, que não podem ser alterados pelo contribuinte.
No entanto, você pode entrar em contato com a Receita Federal, pelo chat, para verificar se há possibilidade de negociar um valor de entrada maior ou condições diferenciadas para o seu cliente.
Espero ter ajudado!