Olá Fernanda, tudo bem?
Você pode gerar um relatório em CSV dos lançamentos que ele fez (entradas e saídas) e comparar com os dados reais das notas fiscais importando os XMLs das notas recebidas direto da SEFAZ, e usar uma planilha comparativa ou algum sistema que mostre as diferenças entre o que foi lançado e o que veio na nota. Assim, você consegue verificar se CFOP, CSOSN, valores e demais informações estão corretos, sem depender apenas do que foi digitado. Isso evita erros manuais e garante mais segurança nas informações fiscais.
Espero ter ajudado.