Olá, Eliene, tudo bem?
Infelizmente não localizei nenhuma orientação específica nos manuais sobre inscrição municipal alfanumérica, só cita que: Este campo é recuperado dos cadastros RFB. Como o emissor nacional não aceita letras, a única forma de preenchimento possível é informar apenas os números.
De toda forma, recomendo também entrar em contato com a prefeitura do município para confirmar a orientação correta. Em alguns casos, o município possui uma versão apenas numérica da inscrição já cadastrada, especialmente agora com a utilização do portal nacional, que não aceita letras.
Segue também o manual anexo.
Espero ter ajudado.
guia-emissorpubliconacionalweb_snnfse-ern-v12.pdf