As notas com o CFOP 5949/6949, normalmente são notas que não tem CFOP específico, e são para corrigir alguma operação, via de regra não houve movimentação bancária sobre essa nota também.
Sendo assim lança em outras entradas 1949/2949
Não podendo tomar crédito de ICMS e nem de PIS e COFINS de empresas do regime normal. Essa nota também não entra no estoque do cliente.
Caso a nota precisa entrar no cliente ou houve movimentação bancária sobre isso, a alta possibilidade dessa nota ter sido emitida com o CFOP incorreta é muito grande, converse com seu cliente para entender exatamente qual operação foi essa, para possível correção na emissão da nota fiscal. Tive um caso bem parecido, que a nota era compra de mercadoria , e estava vindo no CFOP 5949