Olá Daiana, tudo bem?
Para regularizar a empresa, o primeiro passo é levantar todas as pendências.
Acesse o e-CAC e consulte a situação fiscal da empresa. Lá será possível identificar quais períodos estão com pendências de entrega de declarações ou pagamentos de tributos.
Verifique se a empresa emitiu nota fiscal ou teve movimentação financeira desde a abertura. Se sim, será necessário apurar os impostos correspondentes a cada período (se ele não for MEI, o recolhimento dos impostos é encima da receita que ele auferiu), gerar as guias do DAS com multa e juros, e enviar ao cliente para pagamento.
Além disso, entregue todas as obrigações acessórias em atraso, como o PGDAS-D mensal, DCTFWeb e a DEFIS anual.
Após a regularização, oriente o cliente sobre a importância de manter os pagamentos e declarações em dia para evitar sanções, multas, exclusão do simples nacional e a inaptidão do CNPJ.
Espero ter ajudado!