Olá Kesia
Com o cadastro do CNPJ de MEI comércio, a inscrição Estadual é gerado automaticamente pela sefaz, salvo em casos em que o Estado não gera IE para MEI. Por isso, verifique a legislação Estadual para se informar sobre IE para MEI.
MEI não emite notas de entradas, nesse caso, recomendo a guarda dos documentos de aquisição dos produtos importados - Declaração de Importação.
As Notas de Saídas o MEI só é obrigado a emitir nas vendas a CNPJ, mas recomenda se emitir também para CPF para controle gerencial.
Espero ter ajudado