Olá Sabrina
Sim, o lançamento no MIT deve ser feito mesmo quando o valor for inferior a R$ 10,00.
A obrigação acessória é independente da obrigação principal que é recolher via DARF.
Portanto, no seu caso, lance normalmente os valores de PIS e COFINS sobre receitas financeiras no MIT. Não gere DARF se o valor total for inferior a R$ 10,00. Acumule para os períodos seguintes, até atingir ou superar o limite, quando então o recolhimento será devido.
Espero ter ajudado.