Dúvida Relacionado ao curso Dep. Pessoal na Prática

Prezados, boa noite!
Primeiramente gostaria de parabenizar a metodologia dos cursos, pois, tem me surpreendido de forma positiva.
Referente a dúvida, comecei o curso de DP recentemente, talvez o próprio curso explique mais adiante.
Entretanto referente a atividade preponderante como funciona esta classificação? Exemplo a empresa possui 4 atividades secundárias, sei que precisamos classificar com base na atividade que possui mais funcionários, porém, da onde tiramos esta informação? Com base no que o empresário fala ou seria com base nas funções registradas dos funcionários, ou outra forma? Se a resposta for com base nas funções registradas dos funcionários, como associar a função ao CNAE? Pois por exemplo a empresa pode ter os CNAEs:

56.11-2-01 - Restaurantes e similares
56.20-1-04 - Fornecimento de alimentos preparados preponderantemente para consumo domiciliar
Mas a função que mais possui funcionário seja atendente.
Como associar cada função ao CNAE? Alguns casos é fácil, talvez neste exemplo seja até a mesma alíquota, pois não conferi, mas de qual pressuposto devo partir para fazer esta classificação?
Desde já obrigado!