Olá Vanita, tudo bem?
Quando houver dias trabalhados + férias no mesmo mês, você deve fazer da seguinte forma:
Calcula normalmente os dias trabalhados (salário proporcional);
As férias não entram como pagamento na folha, pois já foram quitadas antecipadamente no recibo de férias (com adicional de 1/3);
Na folha mensal, aparecerá as férias de forma informativa (demonstrativa), para compor a base correta de INSS e FGTS.
Lembrando que a soma dos dias trabalhados + dias de férias dentro do mês, precisa equivaler ao salário contratual do colaborador.
Espero ter ajudado.