Olá Mariana, tudo bem?
É normal aparecer saldo a pagar na DCTFWeb mesmo depois do pagamento. A DCTFWeb não dá baixa automática dos valores. Para confirmar se o pagamento foi feito corretamente, é preciso consultar na aba “Pagamentos e Parcelamentos” dentro do e-CAC. Lá é possível visualizar o comprovante de pagamento da guia.
Espero ter ajudado.