Olá Maria, tudo bem?
Como não é possível emitir certificado digital de CNPJ baixado, você pode tentar:
Acessar o e-CAC com o GOV.BR do responsável legal
Trocar o perfil de acesso para o CNPJ
Enviar as DCTFWeb em atraso (sem movimento, se for o caso)
Outra opção é:
Procuração RFB, outorgada quando o CNPJ ainda estava ativo (se existir).
Espero ter ajudado.