Olá Lívia, tudo bem?
Para prestadores autônomos (pessoa física), as retenções de INSS e IRRF devem ser informadas no eSocial.
Já os pagamentos para pessoa jurídica (com nota fiscal) devem ser informados na EFD-Reinf.
O envio em ambos os ambientes para a mesma pessoa (PF) pode gerar duplicidade de informações na declaração do imposto de renda.
Espero ter ajudado.