Olá, boa noite!
É necessário analisar o caso. Normalmente não é permitido que o MEI tenha mais que um CNPJ.
Mas supondo que ela tinha um MEI, encerrou, e depois abriu outro, não há problema. Se as guias estiverem em dia, ela pode ter direito aos auxílios do INSS, observando o tempo de carência mínimo.
É necessário entrar no Meu INSS, e fazer a solicitação do benefício, e aguardar o processamento.
Espero ter ajudado.