Olá, boa tarde!
Por ter perdido o prazo, é necessário aguardar a virada do ano para solicitar o reenquadramento ao MEI. Lembrando, que por ter sido desenquadrado, precisa fazer o processo de alteração na Junta Comercial.
Lembrando, que para solicitar o reenquadramento, precisa estar tudo em dia.
Tem a opção de fazer o encerramento do CNPJ, e tentar abrir outro. Mesmo assim, teria que regularizar as pendências antes da nova abertura.
Quanto aos preços, varia muito de local para local. Seria interessante buscar informações de colegas mais próximos da sua região.
Espero ter ajudado.